WB超级专题月 | WB内参抗体选择指南

为什么需要内参

WB是蛋白定性和定量的金标准,常应用于研究生物样品中蛋白丰度的变化。由于WB检测包含多个步骤,样品制备、上样或转膜等实验过程中任何细微的差异,都可能导致实验结论的不一致,甚至完全相悖。为了避免实验操作差异引起的实验误差,在任何WB检测实验中,都需要设定合适的内参。

内参即内部参照(Internal Control),可以帮助确定样品间表达水平的差异,以判断是由细胞裂解物的实际蛋白水平导致,还是由上样量的差异导致,需要强调的是内参抗体应该与实验抗体在相同的印迹上进行。因此选择的内参蛋白必须是实验样本中稳定表达的蛋白,一般会选择组成型表达且是细胞基本功能必需的管家蛋白(Housekeeping Proteins),如细胞骨架蛋白等。内参蛋白有多种选择,随机选择β-Actinα-Tubulin作为内参并不能满足所有的WB实验,寻找合适的内参是特定WB成功的关键。

内参抗体选择原则

1. 样本来源:

(1)哺乳动物的组织或细胞样本:β-Actinβ-Tubulin、    GAPDH、 Lamin B1PCNAHistone H3等;

(2)植物样本:plant actinRubisco等;

(3)其他来源样本,参照已发表文献,选择合适蛋白作为内参。

2. 目的蛋白分子量:

选择内参抗体时,应该考虑目的蛋白分子量的大小,一般保证目的蛋白与内参蛋白分子量相差5kDa以上。例如,目的蛋白分子量为40kDa,此时不适宜选择β-actinGAPDH作为内参,可以考虑选择α-Tubulin或者β-Tubulin

各内参蛋白分子量详见下表

3. 目的蛋白定位:

(1)细胞质蛋白:β-Actinβ-Tubulinα-TubulinGAPDHVinculinCyclophilin B等;

(2)细胞核蛋白:PCNALamin ALamin BHistone H3K70K80Erk2TATA binding protein (TBP)c-Junc-FosYY1HDAC1等;

(3)细胞膜蛋白:Na+/KATPase等;

(4)细胞质膜蛋白:ATP1A1 (Sodium Potassium ATPase)等;

(5)线粒体蛋白:VDAC1COXIV等;

(6)全血/血浆/血清:TransferrinAlbumin等。

4. 表达水平:

在特定实验条件下(如特殊的实验处理或不同的发育阶段),内参蛋白的表达水平相对于总蛋白需要保持恒定且高表达。常用的内参是由管家基因表达的,是细胞发育和维持细胞活力所必须的蛋白。例如,细胞核的内参蛋白PCNA,在DNA S期表达,因此对于非增殖细胞不推荐使用。

5. 丰度相似性:

实验样本中内参蛋白的表达丰度应与目的蛋白的丰度有相似性,实验方案和检测方法可以揭示内参蛋白和目标蛋白水平的变化,而不会出现信号饱和。如果内参蛋白的表达水平远远高于目的蛋白,必须对内参蛋白进行梯度稀释以确定内参蛋白的检测范围。

6. 表达因素:

(1)选择蛋白表达不受实验变量影响的内参,有研究表明,管家蛋白的表达有时并不恒定,会因实验条件的改变而改变。因此设计实验方案时应该考虑实际的实验因素并查询相应文献,在实验过程中也应该注意内参表达是否出现异常。

(2)在做多组织多细胞样本对比表达量时,最好选用GAPDH作为内参,因为GAPDH是代谢类蛋白,在活组织中表达比较恒定。而β-Actinβ-Tubulin是结构蛋白,不同组织的细胞结构会有差异性。

(3)在某些细胞中,由于组织缺氧、糖尿病等因素会导致GAPDH的表达增高,不适合做内参。

(4)涉及细胞增殖的相关实验中,c-Jun由于自身表达变化不适合做内参。

(5)在做凋亡实验时,TBPLamin等不适合作为内参。

(6)做诱导后样本或检测磷酸化等修饰性抗体时,应选择结构蛋白作为内参,如β-Actinβ-Tubulin

(7)做各种分泌液样本的时候,如血浆、乳汁、组织液等,由于没有完整的细胞结构,只能选择一些分泌蛋白作为内参。

7. 验证内参抗体质量:

(1)阳性对照实验:用已知表达的样本验证抗体有效性。

(2)梯度上样验证:内参条带强度应与上样量呈线性关系。

(3)多内参交叉验证:高分文章标配,比如同时跑β-Actin和 GAPDH

推荐产品

Bioss内参抗体包含不标记产品和标记产品,标记物包括BiotinHRPIRDye800FITCPECy染料和AbBy Fluor ®染料等

全细胞/胞浆 Whole Cell /Cytoplasm
靶点名称产品编号分子量交叉反应产品应用
Beta Actinbsm-33032R43kDaHu, Mo, Rat (Predicted: Rb, Chk, Hamster, Dog)WB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt
bsm-63325R42 kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt,ICC/IF
bs-0061R42kDaHu, Mo, Rat (Predicted: Chk, Dog, Pig, Rb, Shp, Bee, Fish,   Gpig, Hamster, Cat)WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt
bsm-33036M42kDaHu, Mo, Rat (Predicted: Chk, Dog, Rb, Hamster, Mk)WB,IHC-P,IHC-F,IF
GAPDHbsm-52262R38kDaHu, Mo, Rat (Predicted: Zebrafish, Mk)WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt
bsm-33033R38kDaHu, Mo, Rat (Predicted: Hamster, Dog, Pig, Chk, Rb, Mk)WB
bs-10900R38kDaHu, Mo, Rat (Predicted: Hamster)WB,IHC-P,IHC-F,IF,ELISA,IP
bsm-33033M38kDaHu, Mo, Rat (Predicted: Chk, Dog, Pig, Rb, Shp, Hamster, Mk)WB
Beta Tubulinbsm-33034R50kDaHu, Mo, Rat (Predicted: Chk, Dog, Pig, Cow, Rb, Shp, Mk, Gpig)WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt
bs-4511R50kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt
bsm-33120M50kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,IF
bsm-31105M50kDaHu, Mo, RatWB
bsm-33034M50kDaHu, Mo, Rat (Predicted: Chk, Dog, Pig, Cow, Rb, Shp, Gpig, Mk,   Insect/Yeast)WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF
Beta   I Tubulinbsm-33041R50kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,IF,ICC/IF,Flow-Cyt
bsm-61710R50kDaHu, Mo, Rat (Predicted: Mk)WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt
bsm-33041M50kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF
alpha   Tubulinbsm-61711R50kDaYeastWB
bs-0159R50kDaHu, Mo, Rat (Predicted: Shp, Cow)WB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt
Vinculinbsm-54148R124kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,IF
Cyclophilin Bbsm-52473R20kDaHu, Mo, RatWB
bsm-33228M20kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,IF





细胞核 Nuclear Fraction
靶点名称产品编号分子量交叉反应产品应用
Histone   H3bsm-33042R15kDaHu, Rat, Mo (Predicted: Bee, Hamster, Yeast)IHC-P,IHC-F,IF,WB,Flow-Cyt,ICC/IF,ChIP,IP
bs-0349R15kDaHu, Mo, Rat (Predicted: Bee, Hamster, Yeast)WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt
bsm-33042M15kDaHu, Mo, Rat (Predicted: Bee, Hamster, Yeast)WB,IHC-P,IHC-F,IF,ChIP,IP
Lamin Bbsm-33040M64kDaHu, RatWB,IHC-P,IHC-F,IF
PCNAbsm-52347R29kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt
bsm-33035R29kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,IF
bs-0754R29kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt
bsm-33035M29kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt
TATA   binding protein TBP/TFIIDbsm-33227M38kDaHu, Rat (Predicted: Mo)WB,IHC-P,IHC-F,IF
YY1bsm-52349R46kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt
HDAC1bsm-52080R53kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF
bs-24447R53kDaHu, Mo, RatWB
bs-1414R53kDaHu, Mo (Predicted: Rat, Dog, Pig, Cow, Shp, Gpig)WB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt





膜蛋白 Membrane protein
靶点名称产品编号分子量交叉反应产品应用
ATPase   Na+/ K+ beta 2 (ATPB2)bs-23414R33kDaMo, Rat (Predicted: Hu)WB





质膜 Plasma Membrane
靶点名称产品编号分子量交叉反应产品应用
ATP1A1   (Sodium Potassium ATPase)bsm-52485R113kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF
bs-4255R113kDaHu, Mo (Predicted: Rat, Chk, Pig, Rb, Gpig)WB
bsm-34014M113kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,IF
ATP1B2bs-1152R33kDaMo, Rat (Predicted: Hu)WB





线粒体 Mitochondrial Fraction
靶点名称产品编号分子量交叉反应产品应用
COX4bsm-33037R17kDaHu, Mo, RatIHC-P,IHC-F,IF,WB,Flow-Cyt
bsm-33037M17kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,IF
VDAC1bsm-52251R32kDaHu, Mo, RatWB,IHC-P,IHC-F,IF,ICC/IF
VDACbs-1461R32kDaHu, Rat (Predicted: Mo, Dog, Pig, Cow, Hrs, Rb, Shp)WB,IHC-P,IHC-F,IF





全血/血浆/血清 Whole Blood/Plasma/Serum
靶点名称产品编号分子量交叉反应产品应用
Transferrinbs-2052R77kDaHu, Mo, Rat, GoatWB
bsm-33243M77kDaHu, Rat, Mo, CowWB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt
Albuminbs-0945R69kDaHu, Mo, Rat, Goat (Predicted: Dog)WB
bsm-0945M69kDaHu (Predicted: Mo, Rat, Pig)WB
bsm-77001M69kDaHu (Predicted: Mo, Rat, Pig)WB





植物 Plant
靶点名称产品编号分子量交叉反应产品应用
Plant   actinbsm-33128M43kDaVarious PlantsWB





线虫 CAEEL
靶点名称产品编号分子量交叉反应产品应用
Tubulin-alphabsm-8772M51kDaCaenorhabditis ElegansWB
Histone   H3bs-8774R15kDaCaenorhabditis ElegansWB
Beta   Actinbs-8770R42kDaCaenorhabditis ElegansWB
Beta   Actinbsm-8770M42kDaCaenorhabditis ElegansWB





果蝇 Fruit Fly
靶点名称产品编号分子量交叉反应产品应用
Beta   Actinbs-8776R42kDaFruit FlyWB
GAPDHbs-8778R38kDaFruit FlyWB
Actinbsm-8777M42kDaFruit FlyWB





酵母 Yeast
靶点名称产品编号分子量交叉反应产品应用
Beta   Actinbs-8783R42kDaYeastWB
GAPDHbs-8789R38kDaYeastWB
Hu: Human; Mo: Mouse; Shp: Sheep; Rb: Rabbit;   Chk: Chicken; Mk: Monkey ;Gpig: Guinea Pig; Hrs: Horse

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