WB超级专题月 | WB内参抗体选择指南

为什么需要内参
WB是蛋白定性和定量的金标准,常应用于研究生物样品中蛋白丰度的变化。由于WB检测包含多个步骤,样品制备、上样或转膜等实验过程中任何细微的差异,都可能导致实验结论的不一致,甚至完全相悖。为了避免实验操作差异引起的实验误差,在任何WB检测实验中,都需要设定合适的内参。
内参即内部参照(Internal Control),可以帮助确定样品间表达水平的差异,以判断是由细胞裂解物的实际蛋白水平导致,还是由上样量的差异导致,需要强调的是内参抗体应该与实验抗体在相同的印迹上进行。因此选择的内参蛋白必须是实验样本中稳定表达的蛋白,一般会选择组成型表达且是细胞基本功能必需的管家蛋白(Housekeeping Proteins),如细胞骨架蛋白等。内参蛋白有多种选择,随机选择β-Actin或α-Tubulin作为内参并不能满足所有的WB实验,寻找合适的内参是特定WB成功的关键。
内参抗体选择原则
1. 样本来源:
(1)哺乳动物的组织或细胞样本:β-Actin、β-Tubulin、 GAPDH、 Lamin B1、PCNA、Histone H3等;
(2)植物样本:plant actin、Rubisco等;
(3)其他来源样本,参照已发表文献,选择合适蛋白作为内参。
2. 目的蛋白分子量:
选择内参抗体时,应该考虑目的蛋白分子量的大小,一般保证目的蛋白与内参蛋白分子量相差5kDa以上。例如,目的蛋白分子量为40kDa,此时不适宜选择β-actin与GAPDH作为内参,可以考虑选择α-Tubulin或者β-Tubulin。
各内参蛋白分子量详见下表

3. 目的蛋白定位:
(1)细胞质蛋白:β-Actin、β-Tubulin、α-Tubulin、GAPDH、Vinculin、Cyclophilin B等;
(2)细胞核蛋白:PCNA、Lamin A、Lamin B、Histone H3、K70、K80、Erk2、TATA binding protein (TBP)、c-Jun、c-Fos、YY1、HDAC1等;
(3)细胞膜蛋白:Na+/K+ ATPase等;
(4)细胞质膜蛋白:ATP1A1 (Sodium Potassium ATPase)等;
(5)线粒体蛋白:VDAC1、COXIV等;
(6)全血/血浆/血清:Transferrin、Albumin等。
4. 表达水平:
在特定实验条件下(如特殊的实验处理或不同的发育阶段),内参蛋白的表达水平相对于总蛋白需要保持恒定且高表达。常用的内参是由管家基因表达的,是细胞发育和维持细胞活力所必须的蛋白。例如,细胞核的内参蛋白PCNA,在DNA S期表达,因此对于非增殖细胞不推荐使用。
5. 丰度相似性:
实验样本中内参蛋白的表达丰度应与目的蛋白的丰度有相似性,实验方案和检测方法可以揭示内参蛋白和目标蛋白水平的变化,而不会出现信号饱和。如果内参蛋白的表达水平远远高于目的蛋白,必须对内参蛋白进行梯度稀释以确定内参蛋白的检测范围。
6. 表达因素:
(1)选择蛋白表达不受实验变量影响的内参,有研究表明,管家蛋白的表达有时并不恒定,会因实验条件的改变而改变。因此设计实验方案时应该考虑实际的实验因素并查询相应文献,在实验过程中也应该注意内参表达是否出现异常。
(2)在做多组织多细胞样本对比表达量时,最好选用GAPDH作为内参,因为GAPDH是代谢类蛋白,在活组织中表达比较恒定。而β-Actin和β-Tubulin是结构蛋白,不同组织的细胞结构会有差异性。
(3)在某些细胞中,由于组织缺氧、糖尿病等因素会导致GAPDH的表达增高,不适合做内参。
(4)涉及细胞增殖的相关实验中,c-Jun由于自身表达变化不适合做内参。
(5)在做凋亡实验时,TBP、Lamin等不适合作为内参。
(6)做诱导后样本或检测磷酸化等修饰性抗体时,应选择结构蛋白作为内参,如β-Actin和β-Tubulin。
(7)做各种分泌液样本的时候,如血浆、乳汁、组织液等,由于没有完整的细胞结构,只能选择一些分泌蛋白作为内参。
7. 验证内参抗体质量:
(1)阳性对照实验:用已知表达的样本验证抗体有效性。
(2)梯度上样验证:内参条带强度应与上样量呈线性关系。
(3)多内参交叉验证:高分文章标配,比如同时跑β-Actin和 GAPDH。
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| 全细胞/胞浆 Whole Cell /Cytoplasm | ||||
| 靶点名称 | 产品编号 | 分子量 | 交叉反应 | 产品应用 |
| Beta Actin | bsm-33032R | 43kDa | Hu, Mo, Rat (Predicted: Rb, Chk, Hamster, Dog) | WB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt |
| bsm-63325R | 42 kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt,ICC/IF | |
| bs-0061R | 42kDa | Hu, Mo, Rat (Predicted: Chk, Dog, Pig, Rb, Shp, Bee, Fish, Gpig, Hamster, Cat) | WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt | |
| bsm-33036M | 42kDa | Hu, Mo, Rat (Predicted: Chk, Dog, Rb, Hamster, Mk) | WB,IHC-P,IHC-F,IF | |
| GAPDH | bsm-52262R | 38kDa | Hu, Mo, Rat (Predicted: Zebrafish, Mk) | WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt |
| bsm-33033R | 38kDa | Hu, Mo, Rat (Predicted: Hamster, Dog, Pig, Chk, Rb, Mk) | WB | |
| bs-10900R | 38kDa | Hu, Mo, Rat (Predicted: Hamster) | WB,IHC-P,IHC-F,IF,ELISA,IP | |
| bsm-33033M | 38kDa | Hu, Mo, Rat (Predicted: Chk, Dog, Pig, Rb, Shp, Hamster, Mk) | WB | |
| Beta Tubulin | bsm-33034R | 50kDa | Hu, Mo, Rat (Predicted: Chk, Dog, Pig, Cow, Rb, Shp, Mk, Gpig) | WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt |
| bs-4511R | 50kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt | |
| bsm-33120M | 50kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,IF | |
| bsm-31105M | 50kDa | Hu, Mo, Rat | WB | |
| bsm-33034M | 50kDa | Hu, Mo, Rat (Predicted: Chk, Dog, Pig, Cow, Rb, Shp, Gpig, Mk, Insect/Yeast) | WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF | |
| Beta I Tubulin | bsm-33041R | 50kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,IF,ICC/IF,Flow-Cyt |
| bsm-61710R | 50kDa | Hu, Mo, Rat (Predicted: Mk) | WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt | |
| bsm-33041M | 50kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF | |
| alpha Tubulin | bsm-61711R | 50kDa | Yeast | WB |
| bs-0159R | 50kDa | Hu, Mo, Rat (Predicted: Shp, Cow) | WB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt | |
| Vinculin | bsm-54148R | 124kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,IF |
| Cyclophilin B | bsm-52473R | 20kDa | Hu, Mo, Rat | WB |
| bsm-33228M | 20kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,IF | |
| 细胞核 Nuclear Fraction | ||||
| 靶点名称 | 产品编号 | 分子量 | 交叉反应 | 产品应用 |
| Histone H3 | bsm-33042R | 15kDa | Hu, Rat, Mo (Predicted: Bee, Hamster, Yeast) | IHC-P,IHC-F,IF,WB,Flow-Cyt,ICC/IF,ChIP,IP |
| bs-0349R | 15kDa | Hu, Mo, Rat (Predicted: Bee, Hamster, Yeast) | WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt | |
| bsm-33042M | 15kDa | Hu, Mo, Rat (Predicted: Bee, Hamster, Yeast) | WB,IHC-P,IHC-F,IF,ChIP,IP | |
| Lamin B | bsm-33040M | 64kDa | Hu, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,IF |
| PCNA | bsm-52347R | 29kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt |
| bsm-33035R | 29kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,IF | |
| bs-0754R | 29kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF,Flow-Cyt | |
| bsm-33035M | 29kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt | |
| TATA binding protein TBP/TFIID | bsm-33227M | 38kDa | Hu, Rat (Predicted: Mo) | WB,IHC-P,IHC-F,IF |
| YY1 | bsm-52349R | 46kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt |
| HDAC1 | bsm-52080R | 53kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF |
| bs-24447R | 53kDa | Hu, Mo, Rat | WB | |
| bs-1414R | 53kDa | Hu, Mo (Predicted: Rat, Dog, Pig, Cow, Shp, Gpig) | WB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt | |
| 膜蛋白 Membrane protein | ||||
| 靶点名称 | 产品编号 | 分子量 | 交叉反应 | 产品应用 |
| ATPase Na+/ K+ beta 2 (ATPB2) | bs-23414R | 33kDa | Mo, Rat (Predicted: Hu) | WB |
| 质膜 Plasma Membrane | ||||
| 靶点名称 | 产品编号 | 分子量 | 交叉反应 | 产品应用 |
| ATP1A1 (Sodium Potassium ATPase) | bsm-52485R | 113kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,ICC/IF,IF |
| bs-4255R | 113kDa | Hu, Mo (Predicted: Rat, Chk, Pig, Rb, Gpig) | WB | |
| bsm-34014M | 113kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,IF | |
| ATP1B2 | bs-1152R | 33kDa | Mo, Rat (Predicted: Hu) | WB |
| 线粒体 Mitochondrial Fraction | ||||
| 靶点名称 | 产品编号 | 分子量 | 交叉反应 | 产品应用 |
| COX4 | bsm-33037R | 17kDa | Hu, Mo, Rat | IHC-P,IHC-F,IF,WB,Flow-Cyt |
| bsm-33037M | 17kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,IF | |
| VDAC1 | bsm-52251R | 32kDa | Hu, Mo, Rat | WB,IHC-P,IHC-F,IF,ICC/IF |
| VDAC | bs-1461R | 32kDa | Hu, Rat (Predicted: Mo, Dog, Pig, Cow, Hrs, Rb, Shp) | WB,IHC-P,IHC-F,IF |
| 全血/血浆/血清 Whole Blood/Plasma/Serum | ||||
| 靶点名称 | 产品编号 | 分子量 | 交叉反应 | 产品应用 |
| Transferrin | bs-2052R | 77kDa | Hu, Mo, Rat, Goat | WB |
| bsm-33243M | 77kDa | Hu, Rat, Mo, Cow | WB,IHC-P,IHC-F,IF,Flow-Cyt | |
| Albumin | bs-0945R | 69kDa | Hu, Mo, Rat, Goat (Predicted: Dog) | WB |
| bsm-0945M | 69kDa | Hu (Predicted: Mo, Rat, Pig) | WB | |
| bsm-77001M | 69kDa | Hu (Predicted: Mo, Rat, Pig) | WB | |
| 植物 Plant | ||||
| 靶点名称 | 产品编号 | 分子量 | 交叉反应 | 产品应用 |
| Plant actin | bsm-33128M | 43kDa | Various Plants | WB |
| 线虫 CAEEL | ||||
| 靶点名称 | 产品编号 | 分子量 | 交叉反应 | 产品应用 |
| Tubulin-alpha | bsm-8772M | 51kDa | Caenorhabditis Elegans | WB |
| Histone H3 | bs-8774R | 15kDa | Caenorhabditis Elegans | WB |
| Beta Actin | bs-8770R | 42kDa | Caenorhabditis Elegans | WB |
| Beta Actin | bsm-8770M | 42kDa | Caenorhabditis Elegans | WB |
| 果蝇 Fruit Fly | ||||
| 靶点名称 | 产品编号 | 分子量 | 交叉反应 | 产品应用 |
| Beta Actin | bs-8776R | 42kDa | Fruit Fly | WB |
| GAPDH | bs-8778R | 38kDa | Fruit Fly | WB |
| Actin | bsm-8777M | 42kDa | Fruit Fly | WB |
| 酵母 Yeast | ||||
| 靶点名称 | 产品编号 | 分子量 | 交叉反应 | 产品应用 |
| Beta Actin | bs-8783R | 42kDa | Yeast | WB |
| GAPDH | bs-8789R | 38kDa | Yeast | WB |
| Hu: Human; Mo: Mouse; Shp: Sheep; Rb: Rabbit; Chk: Chicken; Mk: Monkey ;Gpig: Guinea Pig; Hrs: Horse | ||||
产品信息以官网为准
验证数据









